Игра основана на истории героев телевизионного сериала Doctor Who, так же в свое время показанного по BBC и снискавшего популярность среди британских зрителей. В каждом из сезонов сериала было по 13 серий, но в этом году разработчики игры заявляют свои четыре части как дополнительные четыре серии сериала, в которых зритель может принять интерактивное живое участие. Судя по комментариям разработчиков, Doctor Who: City of Daleks будет представлять собой нестандартную приключенческую игру с элементами мини-игр, загадок и шпионского квеста. Сюжет своими этапами развития повторяет структуру эпизода сериала, в которых главный герой доктора сталкивается с загадкой, а затем предпринимает ряд действий для ее решения.